웰니스 센터(Wellness Centre)는 4,000평방 미터 규모로 도쿄에서 가장 큰 체육관(340평방 미터)과 도쿄 호텔 내 유일하게 복싱링은 물론, 스피닝 등 그룹 운동을 위한 5개의 무브먼트 스튜디오, 트레이닝, 회복 및 휴식을 위한 최신 시설을 갖추고 있다. 온천 공간은 25m 길이의 온수풀을 중심으로 별도의 라운지 풀, 냉수 및 온수 플런지 풀을 갖춘 2개의 전용 스파하우스, 9개의 트리트먼트룸 및 고압 산소 치료가 가능한 회복실을 갖춰 완전히 새로운 스파 컨셉을 선보일 예정이다. 자누 도쿄 투숙객이 아니더라도 웰니스 콜렉티브(Wellness Collective) 멤버쉽을 통해 시설, 프로그램, 전용 멤버를 위한 라운지를 이용할 수 있다. 

자누 도쿄는 다양한 다이닝 시설을 선보인다. 먼저, 자누 메르카토(Janu Mercato)에서는 활기 넘치는 이탈리아 요리 문화를 경험할 수 있다. 3개의 오픈 키친 카운터를 통해 홈메이드 파스타와 주문 즉시 준비되는 신선한 해산물, 유럽식 돼지고기 요리와 치즈를 제공한다. 유리벽으로 둘러 쌓인 프라이빗 다이닝 공간과 야외 테라스도 갖추고 있어 정원과 녹지 공간을 즐기며 식사를 할 수 있다. 자누 패티세르(Janu Patisserie)는 대리석 벽으로 둘러싸여 있으며, 구움 과자와 파르페 콜렉션을 선보인다. 

또한, 자누 도쿄에는 2개의 일식 레스토랑이 자리한다. 리구라(ligura)는 에도마에 초밥의 오랜 전통을 재해석해 최고급 사시미와 플레이트를 비롯해 오마카세 다이닝을 선보인다. 수미(Sumi)에서는 전통적인 수미비야키(Sumibiyaki) 그릴을 현대적으로 재해석해, 유기농 제철 재료를 숯불로 조리해 프리미엄 와인 또는 사케와 함께 즐길 수 있다. 그 외에도 화려한 키친, 대형 와인 셀러, 바와 카운터를 모두 갖춘 자누 그릴(Janu Grill), 구운 오리, 현대식 딤섬과 해산물을 비롯한 광동 요리를 즐길 수 있는 허징(Hu Jing)을 비롯해 고요한 분위기에서 애프터눈 티와 가벼운 스낵을 즐길 수 있는 자누 라운지와 가든 테라스, 최고의 믹솔로지스트가 제공하는 다채로운 칵테일을 만날 수 있는 자누 바가 마련되었다.